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科學家使用澳大利亞同步加速器識別冠狀病毒蛋白結構

2020-04-13 15:13          同步加速器 粒子加速器

中國核技術網訊:澳大利亞核科學技術組織(ANSTO)在4月7日表示,莫納什大學的研究人員已經確定了新冠狀病毒中一種蛋白質的結構,該蛋白可用于篩選潛在的治療藥物。

研究人員使用澳大利亞同步加速器上的大分子結晶學束線,以原子分辨率確定了SARS-CoV-2蛋白的3D結構。

澳大利亞同步加速器于2007年在維多利亞州墨爾本正式啟動。

3GeV國家同步加速器輻射設施是南半球最大的粒子加速器,可滿足澳大利亞主要大學、研究中心和企業的研究需求。2015年,澳大利亞政府宣布通過ANSTO,進行為期10年的5.2億澳元(3.24億美元)投資。

SARS中的Nsp9蛋白與來自COVID-19的對應蛋白有97%的序列相同。研究人員克隆了一種CoV-19 Nsp9蛋白用于實驗。這些結構在發表在bioRxiv雜志上的一篇論文中進行了描述,可以潛在地用于藥物篩選和靶向實驗中,以破壞病毒的復制。

新型冠狀病毒僅產生27種左右的蛋白質??茖W家試圖了解如何防止這些蛋白質在我們細胞內的產生。

研究人員Dene Littler博士在莫納什大學醫學院生物醫學發現研究所的Jamie Rossjohn教授的實驗室內,研究了SARS-CoV-2產生的一些不太了解的蛋白質。

其中之一,非結構蛋白9(Nsp9)被認為在RNA結合中起作用,眾所周知,SARS中該蛋白的相關版本對于病毒基因組的復制很重要。

Rossjohn說:“這代表了Monash加速研究計劃的開始,該計劃旨在開發新的抗病毒治療以及了解免疫系統如何對抗這種病毒。”

利特勒說:“這將是世界科學家開發一種專門針對日冕病毒蛋白的全新藥物的廣泛戰略的一部分,這種新藥物將阻斷這種病毒在人細胞中感染和繁殖的能力。”

“諸如引起普通感冒的病毒之前沒有足夠的健康影響,因此無法進行大規模的藥物研究計劃。但是,面對當前的大流行,情況已經明顯改變,我們正在玩趕上快節奏的追趕游戲。”

澳大利亞同步加速器可快速跟蹤微焦點晶體學光束線(MX2),以進行COVID-19相關研究。

使用新的MX2光束線上的ACRF檢測器,大約需要18秒鐘來獲取數據集,然后將其用于快速構建Nsp9的晶體結構。”主要科學家Alan Riboldi-Tunnicliffe博士說。

他補充說,MX2具有強大的窄光束,這使研究人員可以專注于晶體的特定部分,并觀察關鍵的相互作用,例如結合。

為響應COVID-19危機,澳大利亞同步加速器一直保持MX2光束線正常運行。研究人員可以將樣品發送到同步加速器并遠程使用該儀器。同步加速器已從澳大利亞,新加坡和中國收到了與CoVID-19有關的樣品。



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